Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPRP12270 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPRP12270 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPRP12270 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPRP12270 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPRP12270 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPRP12270 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPRP12270 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPRP12270 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TPRP12270 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPRP12270 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPRP12270 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRP12270 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRP12270 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRP12270 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRP12270 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRP12270 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRP12270 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRP12270 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRP12270 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRP12270 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRP12270 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms