Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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