Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSLP07711 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSLP07711 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSLP07711 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms