Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms