Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms