Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF2O60811 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms