Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ZIC3O60481 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC3O60481 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC3O60481 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC3O60481 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC3O60481 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC3O60481 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC3O60481 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC3O60481 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC3O60481 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZIC3O60481 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZIC3O60481 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC3O60481 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC3O60481 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC3O60481 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC3O60481 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC3O60481 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC3O60481 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC3O60481 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC3O60481 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms