Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFS4O43181 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms