Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP290O15078 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP290O15078 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP290O15078 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP290O15078 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP290O15078 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP290O15078 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP290O15078 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CEP290O15078 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CEP290O15078 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP290O15078 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CEP290O15078 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CEP290O15078 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CEP290O15078 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP290O15078 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP290O15078 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP290O15078 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CEP290O15078 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CEP290O15078 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CEP290O15078 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CEP290O15078 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP290O15078 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP290O15078 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP290O15078 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP290O15078 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP290O15078 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP290O15078 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP290O15078 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP290O15078 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP290O15078 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP290O15078 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP290O15078 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CEP290O15078 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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