Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PODXLO00592 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PODXLO00592 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PODXLO00592 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms