Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVH48-1M5A8F1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms