Protein–RNA interactions for Protein: K7EIQ3

ZNF561-AS1, Uncharacterized protein ZNF561-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF561-AS1K7EIQ3 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF561-AS1K7EIQ3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms