Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CCDC179H3BU77 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms