Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ08

MBD3L5, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L5A6NJ08 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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MBD3L5A6NJ08 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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MBD3L5A6NJ08 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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MBD3L5A6NJ08 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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MBD3L5A6NJ08 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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