Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM247A6NEH6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms