Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms