Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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CCL27Q9Y4X3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CCL27Q9Y4X3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CCL27Q9Y4X3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CCL27Q9Y4X3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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CCL27Q9Y4X3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CCL27Q9Y4X3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CCL27Q9Y4X3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CCL27Q9Y4X3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CCL27Q9Y4X3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CCL27Q9Y4X3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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CCL27Q9Y4X3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL27Q9Y4X3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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