Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms