Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms