Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms