Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDP1Q9P0J1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms