Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms