Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms