Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms