Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms