Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms