Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms