Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms