Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms