Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP7

VN1R1, Vomeronasal type-1 receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R1Q9GZP7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VN1R1Q9GZP7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms