Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMBRA1Q9C0C7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms