Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP3Q9BZ76 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms