Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms