Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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KRTAP9-3Q9BYQ3 APCDD1L-AS1-204ENST00000427794 461 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000688.3-201ENST00000445464 348 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE4D-209ENST00000502575 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC074051.4-201ENST00000564888 892 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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KRTAP9-3Q9BYQ3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
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