Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms