Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms