Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms