Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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