Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms