Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms