Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms