Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRBNQ96SW2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms