Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A2Q96QD8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms