Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms