Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms