Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX27Q96L92 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms