Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms