Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms