Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms