Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHFRQ96EP1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms